2000 yılında Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi’nden mezun oldu. İbn Sînâ Felsefesinde Âlemin Mükemmelliği Düşüncesi başlıklı tezle 2002 yılında Marmara Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Felsefe ve Din Bilimleri Anabilim Dalı’nda yüksek lisansını tamamladı. 2005- 2006 yıllarında Yale Üniversitesi (ABD) Yakın Doğu Dilleri ve Medeniyetleri Bölümü’nde araştırmacı olarak çalışmalarını sürdürdü. 2008 yılında İstanbul Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Felsefe ve Din Bilimleri Anabilim Dalı’nda tamamladığı İslam Felsefesinde Metafizik Bir Problem Olarak İmkân başlıklı tezle doktor unvanı aldı. 2009’dan bu yana İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Felsefe Bölümü Türk-İslam Düşünce Tarihi Anabilim Dalı’nda öğretim üyesi olarak görev yapmakta olan Kaya, 2012 yılında Felsefe alanında doçentlik unvanını hak etti. 2018’de profesör olan Kaya, 2016-2019 yılları arasında aynı fakülteye bağlı İslam Araştırmaları Merkezi müdürü olarak görev yapmıştır.
Eğitim bilgileri 1. Doktora, 1992 - 2000, Ege Üniversitesi, Edebiyat Fakültesi, Felsefe Bölümü, Türkiye, Türkçe 2. Yüksek Lisans, 1990 - 1992, Ege Üniversitesi, Sosyal Bilimler Enstitüsü, Türkiye, Türkçe 3. Lisans, 1983 - 1987, Ege Üniversitesi, Edebiyat Fakültesi, Felsefe Bölümü, Türkiye, Türkçe Akademik unvanlar / görevler 1. Doç. Dr., 2016 - , Ege Üniversitesi, Edebiyat Fakültesi, Felsefe Bölümü, Türk-İslam Düşünce Tarihi Ana Bilim Dalı, Türkiye Akademik idari deneyim 1. Bölüm Başkanı, 2017 - , Ege Üniversitesi, Edebiyat Fakültesi, Felsefe Bölümü, Türkiye