Eyüp Süzgün, 2002 yılında İstanbul Üniversitesi Eczacılık Fakültesi’nden mezun oldu. Ardından, Marmara Üniversitesi Felsefe ve Din Bilimleri Bilim Dalında yüksek lisansını tamamladı. 2012–2014 yılları arasında Ottawa Üniversitesi Zihin Sağlığı Araştırma Enstitüsü Beyin Görüntüleme, Zihin ve Nöroetik Birimi’nde misafir araştırmacı olarak bulundu. Halen İstanbul Üniversitesi Felsefe Bölümü’nde beyin, bilinç ve benlik arasındaki ilişkilere odaklanan doktora çalışmasını sürdürmektedir.